Родился в Риге.
Окончил Ленинградский государственный университет.
Журналист, писатель.
Автор более десяти книг. Член Союза писателей России и правления Союза журналистов Санкт-Петербурга и Ленинградской области.
Лауреат премии Союза журналистов СССР, премии правительства Санкт-Петербурга, премии имени Матвея Фролова.
При поддержке «Созидающего мира» была опубликована «книга-путешествие» Анатолия Аграфенина «Серебряное кольцо», посвященная достопримечательностям Северо-Запада России.
Под эгидой проекта Вячеслава Заренкова также вышла в свет книжная трилогия автора «Неизвестная блокада: Малая дорога жизни», «Неизвестная блокада: путь на острова», «Неизвестная блокада: две дороги», освещающая малоизвестные факты Великой Отечественной войны и ленинградской блокады.
В 2018 году за серию публикаций, посвященных теме блокады и Малой дороги жизни, Анатолий Аграфенин удостоен звания лауреата конкурса журналистских работ, проводимого фондом «Правда и справедливость» Общероссийского народного фронта.
В 2020 году книга «Неизвестная блокада: две дороги» вошла в список лауреатов литературного конкурса Всероссийской историко-литературной премии «Александр Невский».
«Сейчас, когда многие в мире возводят стены, разъединяющие страны, мы строим мосты, соединяющие культуры»